輔酶是一大類有機輔助因子的總稱，是酶催化氧化還原反應、基團轉移和異構反應的必須因子。它們在酶催化反應中承擔傳遞電子、原子或基團的功能。輔酶也可以被視為第二底物，因為在催化反應發生時，輔酶發生的化學變化與底物正好相反。輔酶是一類可以將化學基團從一個酶轉移到另一個酶上的有機小分子，與酶較為松散地結合，對于特定酶的活性發揮是必要的。有許多維他命及其衍生物，如核黃素、硫胺素和葉酸，都屬于輔酶。這些化合物無法由人體合成，必須通過飲食補充。不同的輔酶能夠攜帶的化學基團也不同：NAD+或NADP+攜帶還原性氫，輔酶A攜帶乙酰基，葉酸攜帶甲酰基，S-腺苷基蛋氨酸也可攜帶甲酰基。
由于輔酶在酶催化反應中其化學組分發生了變化，因此可以認為輔酶是一種特殊的底物或者稱為“第二底物”。這種所謂的第二底物可以被許多酶所利用。例如，目前已知有約七百種酶可以利用輔酶NADH進行催化。
在細胞內，反應后的輔酶可以被再生，以維持其胞內濃度在一個穩定的水平上。例如，NADPH可以通過磷酸戊糖途徑和甲硫氨酸腺苷基轉移酶作用下的S-腺苷基蛋氨酸來再生。由于輔酶的再生對于維持酶反應體系的穩定是必要的，因此，輔酶再生系統獲得了大量的實驗室以及工業應用。（輔酶不可以被叫做催化劑）
輔酶主要的作用
1. 抗心肌缺血作用。
2. 增加心輸出量，降低外周阻力，有助于抗心衰作用，醛固酮的合成與分泌有抑制作用并干擾其對腎小管的效應。
3. 抗心律失常作用。
4. 使外周血管阻力下降。
5. 能激活人體細胞和細胞能量的營養，具有提高人體免疫力、增強抗氧化、延緩衰老和增強人體活力。此外，還有抗阿霉素的心臟毒性作用及保肝等作用。
